De operationele afdeling van COVA is verantwoordelijk voor het selecteren van geschikte opslaglocaties tegen zo laag mogelijke kosten voor de noodvoorraad olie. De olievoorraden moeten gehouden worden tegen vooraf vastgestelde kwaliteitsspecificaties en moeten vervangen worden bij wijzigingen in specificaties of opslaglocaties. COVA werkt conform de internationale en nationale milieuregels.

COVA is afhankelijk van de voorraadheffing die is vastgesteld in de Wet Voorraadvorming Aardolieproducten 2001, op € 5,90/m³ . De voorraadheffing is bedoeld om de operationele kosten en financieringslasten van COVA te dekken. De heffing kan aangepast worden middels een Algemene Maatregel van Bestuur. De voorraadheffing bedraagt momenteel € 5,90 /m³.